邛崃属亚热带湿润季风气候区，冬无严寒，夏无酷热，气候温和，雨量充沛，四季分明。年平均气温16.8℃，年总降雨量1041.3毫米，年相对湿度82%，年日照时数894.9小时，最多风向为北风。2021年，森林面积101.5万亩，森林覆盖率49.06%。境内生物资源丰富，植物资源共100科426种，其中名贵珍稀植物16科20余种，其中国家一级保护野生植物7种，国家二级保护野生植物10种，省级保护野生植物15种。野生动物种类繁多，其中名贵珍稀野生动物10科50余种。

境内地貌，山、丘、坝皆有。东部及东北部为平坝，地形平坦、开阔，略有起伏，面积311；南部为五面山、长丘山区，浅丘连绵，塘库棋布；中部西北缘为深丘，是浅丘与西部山区间的过渡带，面积；西部为龙门山南段延伸山系，地势起伏较大，山峦重叠，沟壑纵横。南宝山镇玉林山峰顶为最高点，海拔2025米；最低点在南河流出市境的羊安街道与新津区永商镇交界处的河心，海拔453.5米。

境内矿产资源丰富，尤以天然气、钾盐为盛，川西地区最大气田，开采的天然气供川西地区使用。钾盐矿物质品位属国内之冠。还蕴藏有沙金、钙芒硝、页岩、石灰石、沙石、石材、黏土、泥炭、石膏、菱铁矿、铜矿、黄铁矿、煤等矿产资源可供开发利用。

境内河道纵横，水利资源丰富。南河、出阝江河、斜江河、蒲江河、玉溪河五条主要河流流经境内，全长217.15千米。地表水年径流量9.91亿立方米，其中可利用量5.33亿立方米。