西汉、东汉、三国蜀汉时期，安县为涪县辖地。东晋永和三年(公元347年)，建县之始。侨置晋兴、益昌、西充国三县，属巴西郡。晋兴县治地今永安镇向阳村，益昌县治地今花荄镇联丰村观斗山,西充国县治地今沸水镇街场。义熙九年（公元413年），设置西浦县，属梓潼郡，西浦县治地今塔水镇神泉村。隋朝开皇三年(公元583年),益昌县撤销并入金山县；开皇六年(586年)，在平川县故城（今塔水镇神泉村）新置神泉县。金山、神泉二县均属绵州。

唐朝武德三年(公元620年),在金山县故城(今永安镇向阳村)新置龙安县；永淳元年（公元682年），在益昌县故城（今花荄镇联丰村观斗山）新置西昌县；神泉县仍置。龙安、西昌、神泉三县均属绵州。北宋熙宁五年（公元1072年），西昌县撤销并入龙安县，神泉县仍置，二县均属绵州。政和七年(公元1117年)，割绵州辖之神泉、龙安二县与茂州辖之石泉县设置石泉军,治地今北川县治城镇,石泉军隶属成都府路。南宋宝祐三年（公元1255年），石泉军迁治龙安县城（今永安镇向阳村）。元朝中统五年（公元1264年），升石泉军为安州。龙安、神泉二县撤销，地域由州直辖，州仍辖石泉县。安州属成都府路。明朝洪武七年(公元1374年),降安州为安县,并迁治今安昌镇,属成都府。清朝雍正五年(公元1727年)，绵州升为直隶州,安县改属绵州（清康熙年间,湖广填川大迁徙,安县移民增多）。

中华民国时期，1913年，撤销绵州，安县属四川省第十三行政督察区。中华人民共和国成立后，1949年12月25日,

安县和平解放。1950年,安县属川西行署区绵阳专区。1952年，撤销行署区设置四川省,安县属四川省绵阳专区。1968年,改绵阳专区为绵阳地区,安县属四川省绵阳地区。1985年2月,撤销绵阳地区,建置绵阳市,安县属四川省绵阳市辖。2002年4月16日,安县人民政府驻地由安昌镇迁址花荄镇。

2009年4月3日,安县的安昌镇、永安镇和黄土镇的常乐、红岩、顺义、红旗、温泉、东鱼6个村划归北川羌族自治县管辖。2016年5月20日，安县撤县设区，成立绵阳市安州区。2019年，安州区行政区划调整所辖乡镇由18个调整至10个，辖花荄、界牌、黄土、桑枣、秀水、雎水、河清、塔水、千佛、高川乡9镇1乡，117个行政村，1301个村民小组，34个社区。